Postdoctoral position on archaea-bacteria interactions and cooperation
Oversigt og nøgleindsigter
Stillingen som postdoc ved Aarhus Universitet fokuserer på interaktioner mellem archaea og bakterier, specielt i anaerobe miljøer. Projektet sigter mod at afdække mekanismerne bag elektronstransfer i syntrofiske partnerskaber.
Højdepunkter
- Forskning i dybhavssyntrofiske konsortier
- Brug af avancerede teknikker som elektrokemi og mikroskopi
- Mulighed for at arbejde med unikke berigelseskulturer
Påkrævede kvalifikationer
- • PhD i mikrobiologi, bioelektrokemi eller relateret felt
- • Solid baggrund i anaerob mikrobiologi og elektrokemi
- • Gode kommunikationsevner på engelsk
Ønskværdige kvalifikationer
- • Erfaring med mikrobiologisk elektrokemi
- • Kendskab til metabolomik og meta-omik
Den ideale kandidat
Den ideelle kandidat har en stærk interesse for mekanistisk forskning i mikrobiologi og elektrokemi. De skal være samarbejdsvillige og åbne for tværfagligt arbejde i komplekse anaerobe systemer.
Jobdetaljer
Jobbeskrivelse
Job Description
Hydrocarbon-oxidizing archaea form obligate syntrophic partnerships with sulfate-reducing bacteria (SRB), enabling the anaerobic turnover of hydrocarbons in marine sediments. Despite their global importance, the mechanistic basis of this metabolic coupling remains unresolved: whether electron transfer proceeds via diffusible intermediates or through direct, cell-to-cell electron transfer (DIET) is still under active debate.
This project aims to resolve the mechanism of archaeal-bacterial electron transfer in these systems. By combining cultivation-based microbiology with electrochemical approaches and high-resolution imaging, the work will directly probe how energy metabolism is physically and functionally coupled across domains of life.
The project will involve working with syntrophic deep-sea consortia, performing strictly anoxic physiological experiments, and developing electrode-based systems to probe extracellular electron transfer. The successful candidate will have the opportunity to work with unique enrichment cultures and contribute to a mechanistic framework for one of the central processes in anaerobic microbiology.
The postdoctoral researcher will employ a combination of:
- Anaerobic cultivation and experimentation with syntrophic consortia
- Physiology assays with cultures, cell suspensions, and cell-free extracts
- Microbial electrochemistry, including setting up and operating microbial fuel cells (MFC) under anoxic conditions
- Stable isotope labeling coupled to metabolomics
- Fluorescence in situ hybridization (FISH, CARD-FISH), advanced microscopy, community sequencing, and metagenomics
The work will be carried out in the Archaea group, Section for Microbiology, Department of Biology with collaborations at the Helmholtz Centre for Environmental Research – UFZ, Leipzig, Germany and the University of Southern Denmark - SDU, Odense, Denmark.
The postdoctoral fellow will benefit from MicroCorr, a next-generation imaging platform integrating confocal laser scanning microscopy and Raman microscopy, enabling combined structural, functional, and live/dead-resolved single-cell analyses. The platform will be established during 2026, and the postdoc will have the opportunity to help shape its application to complex microbial systems.
Required research experience
We seek candidates with a strong background in anaerobic microbiology, microbial physiology, electromicrobiology, molecular biology, or related disciplines, and a scientific interest in mechanistic questions at the interface of microbiology and electromicrobiology.
Experience in one or more of the following areas is desirable:
- Microbial electrochemistry (e.g., MFC, cyclic voltammetry)
- Anaerobic cultivation and handling of strictly anoxic systems
- Microbial physiology assays, analytical chemistry and metabolomics
- Meta-omics approaches
- Fluorescence in situ hybridization (FISH, CARD-FISH) & advanced microscopy.
Candidates with experience in electromicrobiology/MFC who are motivated to engage with complex anaerobic syntrophic systems are particularly encouraged to apply.
Qualifications
- PhD in microbiology, bioelectrochemistry, molecular biology, or a related field
- Strong collaborative mindset and interest in interdisciplinary work
- Excellent written and oral communication skills in English
The deadline for applications is 1 May 2026. Applicants seeking further information are invited to contact Associate Professor Florin Musat (florin.musat@bio.au.dk).
Karrierevej
Typisk karriereforløb
Senior Researcher
Research Group Leader
Professor
Vækstpotentiale
Stillingen giver mulighed for at udvikle ekspertise inden for anaerob mikrobiologi og elektrokemi, hvilket er eftertragtede kompetencer i både akademiske og industrielle sammenhænge. Derudover kan erfaringen med avanceret mikroskopi og metagenomik åbne døre til ledende forskningspositioner.
Overførbare færdigheder
Branchekontekst
Forskningen inden for archaea-bakterie interaktioner er central for forståelsen af biogeokemiske cykler i marine miljøer. Stillingen bidrager til den voksende viden om anaerob mikrobiologi, som er afgørende for miljømæssige og bioteknologiske anvendelser.
Færdighedsanalyse
Kritiske færdigheder
Dybtgående forståelse af anaerobe økosystemer og mikroorganismer.
Vigtige færdigheder
Erfaring med opstilling og drift af mikrobielle brændselsceller under anoxiske forhold.
Færdigheder i molekylære teknikker relateret til mikrobiologi.
Ønskværdige færdigheder
Evne til at anvende FISH og avanceret mikroskopi til analyse af mikrobielle samfund.
Kendskab til metabolomiske tilgange og stabil isotop mærkning.
Erfaring med meta-genomiske og meta-transkriptomiske metoder.
Mest kritiske færdigheder
Sådan fremhæver du din erfaring
Fremhæv din erfaring med anaerob mikrobiologi og mikrobiel elektrokemi, især hvis du har arbejdet med anoxiske systemer eller MFC. Beskriv specifikke projekter eller teknikker, du har anvendt, der relaterer til disse områder.
Interviewforberedelse
Sandsynlige spørgsmål
Hvad er din erfaring med anaerob mikrobiologi?
erfaringTip: Fokuser på specifikke projekter, du har arbejdet med, og resultaterne.
Kan du beskrive en situation, hvor du har arbejdet med syntrofiske konsortier?
situationTip: Giv konkrete eksempler på metoder og resultater.
Hvordan vil du håndtere anoxiske eksperimenter i laboratoriet?
tekniskTip: Beskriv din erfaring med udstyr og sikkerhedsforanstaltninger.
Hvilken viden har du om mikrobiologisk elektrochemistry?
tekniskTip: Nævn specifikke teknikker som MFC og cyklisk voltammetri.
Hvordan ser du samarbejdet mellem forskellige institutioner i dette projekt?
kulturTip: Vis, at du værdsætter samarbejde og tværfaglighed.
Spørgsmål du kan stille
- Hvilke specifikke mål har I for dette forskningsprojekt?
- Hvordan vil succes blive målt for denne stilling?
- Hvilke ressourcer vil være tilgængelige for at støtte forskningen?
Tale punkter
- Min baggrund i anaerob mikrobiologi og relevante projekter.
- Min erfaring med elektrochemistry og hvordan det kan anvendes i projektet.
- Min interesse for tværfaglig forskning og samarbejde.
Bekymringspunkter at være opmærksom på
- Manglende erfaring med de specifikke teknikker, der nævnes i stillingsopslaget.
- Uvillighed til at samarbejde med internationale forskningsinstitutioner.
Ansøgningsstrategi
Ansøgningstips
- Fremhæv din erfaring med anaerob mikrobiologi og mikrobiologiske fysiologiske eksperimenter.
- Inkluder specifikke eksempler på tidligere projekter, hvor du har arbejdet med mikrobiologisk elektrokemi eller metagenomik.
- Vis din interesse for samarbejde ved at nævne relevante erfaringer fra tidligere samarbejder med forskningsinstitutioner.
Nøgleord at inkludere
Fokus i ansøgningen
Fremhæv din dybtgående viden om syntrofiske partnerskaber og din erfaring med elektrokemiske metoder, samt hvordan du kan bidrage til projektet med innovative tilgange.
Tilpasning af CV
Tilpas dit CV ved at fremhæve relevante forskningsprojekter og tekniske færdigheder, der matcher kravene i stillingsopslaget, især inden for anaerob dyrkning og elektrokemiske eksperimenter.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad indebærer stillingen?
Stillingen som postdoc fokuserer på interaktioner mellem archaea og sulfat-reducerende bakterier, med henblik på at afdække mekanismerne bag elektronoverførsel i anaerobe miljøer. Arbejdet involverer eksperimenter med syntrofiske konsortier og udvikling af elektrodesystemer til at undersøge ekstracellulær elektronoverførsel.
Hvilke kvalifikationer kræves?
Vi søger kandidater med en stærk baggrund inden for anaerob mikrobiologi, mikrobiologisk fysiologi eller relaterede discipliner. Erfaring med mikrobiologisk elektrokemi, anaerob dyrkning, og avanceret mikroskopi samt interesse for mekanistiske spørgsmål er ønskeligt.
Hvad tilbyder virksomheden?
Aarhus Universitet tilbyder et dynamisk forskningsmiljø med adgang til avancerede faciliteter som MicroCorr, en next-generation imaging platform. Postdoc'en vil få mulighed for at bidrage til banebrydende forskning og samarbejde med internationale forskningscentre.
Hvordan er arbejdsmiljøet?
Arbejdsmiljøet er præget af samarbejde og innovation, med fokus på at opnå videnskabelige fremskridt. Du vil arbejde tæt sammen med et team af forskere og have mulighed for at deltage i tværfaglige projekter.
Hvad er forventningerne til den ansatte?
Forventningerne inkluderer aktiv deltagelse i forskningsprojekter, udførelse af eksperimenter og bidrag til publicering af forskningsresultater. Du skal være i stand til at arbejde selvstændigt samt i teams og have en proaktiv tilgang til problemløsning.
Hvilke metoder vil jeg arbejde med i denne stilling?
Du vil arbejde med en række metoder, herunder anaerob dyrkning, mikrobiologiske fysiologiske assays, samt brug af fluorescens in situ hybridisering (FISH) og metagenomik for at studere mikrobiologiske interaktioner.
Hvilke samarbejdsmuligheder er der?
Stillingen inkluderer samarbejde med forskere fra Helmholtz Centre for Environmental Research i Leipzig og Syddansk Universitet i Odense, hvilket giver mulighed for at udveksle viden og erfaringer på tværs af institutioner.